Mulder riceve un’informazione in codice da Deep Throat, riguardante un incidente nel quale un fuggitivo è riuscito ad eludere la polizia dopo un lungo inseguimento. Durante le fuga, il sospetto è stato colpito dalla polizia prima che cadesse nel lago. Dopo molte ore di ricerca, però, il suo corpo non è stato ritrovato. Mulder avvia le sue indagini, e capisce che qualcuno ha scambiato la macchina del fuggitivo.

Gli agenti rintracciano la macchina originale al dottor Berube, uno scienziato che non è molto propenso a collaborare con l’FBI. Non sapendo come procedere, gli agenti decidono di lasciare le indagini. Ma ancora una volta Deep Throat contatta Mulder, convincendolo che il caso è di estrema importanza. Nel frattempo, viene scoperto il cadavere del dottor Berube nel suo laboratorio.

La polizia termina le indagini senza scoprire il corpo del fuggitivo. Ma proprio in quel momento, il misterioso uomo risale da sotto la superficie del lago: le branchie nella sua nuca gli hanno permesso di rimanere sott’acqua per un lungo periodo. Il fuggitivo si avvia vero la città, cerca il dottore Berube ma sviene poco prima. L’ambulanza lo porta all’ospedale, e i medici gli inseriscono un ago nella sua pelle. Improvvisamente un gas si sprigiona dal corpo, intossicando i medici, e il fuggitivo ne approfitta per scappare.

Con l’aiuto del dottoressa Carpenter, Scully analizza una provetta presa dal laboratorio del dottor Berube, e scoprono che contiene una batterio di origine extraterrestre. Mulder scopre un magazzino contenente corpi umanoidi immersi in un liquido chiaro, ma quando ritorna nella stanza con Scully, la trova vuota. Deep Throat spiega che il dottor Berube stava sperimentando virus alieni, usando come cavie i corpi di malati terminali. L’esperimento era finanziato dal governo degli Stati Unti, e gli ufficiali erano interessati solo ai risultati, non alla salute dei pazienti. Uno di questi pazienti era il dottor Secare, un amico del dottor Berube. Quando Berube capì che il governo voleva eliminare Secare, lo avvertì del pericolo e gli diede la sua macchina per fuggire. Inseguito dalla polizia, Secare usò la sua mutazione per restare sommerso nel lago.

Scully rimane stupita quando viene a sapere della morte della dottorssa Carpenter, a causa di un incidente automobilistico. Subito dopo Mulder trova il dottor Secare che si nasconde nel suo attico; anche un ufficiale del governo li trova, uccidendo il dottore e sequestrando Mulder.

Quando Mulder scompare, Scully contatta Deep Throat, che le dà accesso ad un edificio top-secret nel Maryland. Scully trova e ruba un feto alieno, e con l’aiuto di Deep Throat scambia Mulder con il feto. Subito dopo lo scambio, Deep Throat viene ucciso dall’agente del governo. Più tardi, Mulder dice a Scully che il governo sta chiudendo gli X-Files. 

Attori Protagonisti
DAVID DUCHOVNY - Agente Speciale Fox Mulder
GILLIAN ANDERSON - Agente Speciale Dana Scully

Attori Co-Protagonisti
JERRY HARDIN - Deep Throat
LINDSEY GINTER - Crew-Cut Man
ANNE DESALVO - Dr. Anne Simon
SIMON WEBB - Dr. Secare
JIM LEARD - Capitano Lacerio
KEN KRAMER - Dr. Berube
PHILLIP MacKENZIE - Medico
WILLIAM B. DAVIS - Uomo che Fuma
JAYLENE HAMILTON - Reporter
MIKE MITCHELL - Primo poliziotto in uniforme
JOHN PAYNE - Guardia 

Autori
CHRIS CARTER

Diretto da
R.W. GOODWIN

Trasmesso la prima volta in TV
13/05/94
01/10/95

La fine di questo episodio rispecchia la fine dell’episodio pilota, Mulder chiama Scully alle 11:21, e l’Uomo che Fuma nasconde le prove dell’esistenza degli alieni all’interno del Pentagono.

La stanza contenente le persone nelle vasche è dietro la porta numero 1056 – il mese e l’anno di nascita di Chris Carter

Il feto alieno è tenuto al High Containment Facility di Fort Marlene. Sebbene non esista un reale Fort Marlene, c’è un Fort Dietrich nel Maryland – un luogo noto per i suoi esperimenti con le armi biologiche. Il forte di X-Files è un omaggio a Marlene Dietrich o è un riferimento al vero Fort Dietrich del Maryland?

Il pontile dal quale spicca il volo il dottor Secare era la punta estrema del Versatile Shipyards nelle acque gelide del North Vancouver.

TAG LINE - La familiare “The truth is out there” nei titolo iniziali viene cambiata per la prima volta in questo episodio. Viene sostituita con “Trust no one” – la frase pronunciata da Deep Throat a Scully in punto di morte.

[Gola Profonda] Non vi fidate… non vi fidate di nessuno.

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[Mulder] Ci hanno fatto fuori, Scully.
[Scully] E tu che cosa farai?
[Mulder] Io non mi arrendo Scully, non posso arrendermi, non finchè ci sarà una verità da scoprire.

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Ciao, sono Bob Goodwin. Ho diretto questo episodio, The Erlenmeyer Flask, che era il nostro finale di stagione del primo anno, ed uno degli episodi che ha lanciato la serie verso il successo. Questo pezzo della scena di apertura qui, tutte queste riprese di queste auto che si rincorrono l’un l’altra con il treno, il volare sopra le rotaie, la maggior parte di queste sono state girate da John Patrick Finn, che era il nostro produttore ed ha diretto questa grandiosa sequenza realizzata dalla seconda unità. Ha fatto un ottimo lavoro, ci ha messo molto entusiasmo. Questo era ...

FBI Headquarters - Washington, D.C.

Emgen Corporation - Gaithrsburg, Maryland

Georgetown University Microbiology Department

Zeus Storage, 1616 Pandora Street

Fort Marlene High Containment Facility

Washington, D.C.

Appartamento di Mulder
2630 Hegal Place - Appartamento num. 42 Alexandria, Virginia 23242

Per ulteriori informazioni sugli eventi accaduti in questo episodio consulta la timeline di questa stagione